Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCANQ96GW7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BCANQ96GW7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms