Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKD1Q969G9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKD1Q969G9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms