Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRF1Q92994 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRF1Q92994 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms