Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF1Q92879 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms