Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF4BQ92750 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms