Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTLL11Q8NHH1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms