Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM8

AGBL3, Cytosolic carboxypeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL3Q8NEM8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
AGBL3Q8NEM8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGBL3Q8NEM8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms