Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM7

SUPT20H, Transcription factor SPT20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT20HQ8NEM7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUPT20HQ8NEM7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT20HQ8NEM7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms