Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW6

N4BP2, NEDD4-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP2Q86UW6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
N4BP2Q86UW6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
N4BP2Q86UW6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
N4BP2Q86UW6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP2Q86UW6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP2Q86UW6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP2Q86UW6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP2Q86UW6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP2Q86UW6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP2Q86UW6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP2Q86UW6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP2Q86UW6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP2Q86UW6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP2Q86UW6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP2Q86UW6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP2Q86UW6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP2Q86UW6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP2Q86UW6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP2Q86UW6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP2Q86UW6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP2Q86UW6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP2Q86UW6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP2Q86UW6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP2Q86UW6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP2Q86UW6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP2Q86UW6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP2Q86UW6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP2Q86UW6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP2Q86UW6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
N4BP2Q86UW6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
N4BP2Q86UW6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
N4BP2Q86UW6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
N4BP2Q86UW6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms