Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SMIM5Q71RC9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms