Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP50Q70EL3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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