Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms