Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSY5

PPP1R3F, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3FQ6ZSY5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R3FQ6ZSY5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PPP1R3FQ6ZSY5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPP1R3FQ6ZSY5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3FQ6ZSY5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3FQ6ZSY5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3FQ6ZSY5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3FQ6ZSY5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3FQ6ZSY5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3FQ6ZSY5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3FQ6ZSY5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3FQ6ZSY5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3FQ6ZSY5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3FQ6ZSY5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3FQ6ZSY5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3FQ6ZSY5 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3FQ6ZSY5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3FQ6ZSY5 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3FQ6ZSY5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3FQ6ZSY5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3FQ6ZSY5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3FQ6ZSY5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3FQ6ZSY5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3FQ6ZSY5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3FQ6ZSY5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3FQ6ZSY5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R3FQ6ZSY5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms