Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR88Q6ZMY6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR88Q6ZMY6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms