Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCSAPQ6IQ19 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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