Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF123Q5XPI4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms