Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SHEQ5VZ18 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms