Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOGA3Q5TF21 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOGA3Q5TF21 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms