Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RSPH4AQ5TD94 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms