Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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E2F4Q16254 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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E2F4Q16254 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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E2F4Q16254 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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E2F4Q16254 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F4Q16254 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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