Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDSNQ15517 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
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