Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
RYR3Q15413 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RYR3Q15413 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms