Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDGFRLQ15198 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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