Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COL19A1Q14993 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL19A1Q14993 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL19A1Q14993 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL19A1Q14993 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL19A1Q14993 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL19A1Q14993 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL19A1Q14993 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL19A1Q14993 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL19A1Q14993 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL19A1Q14993 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL19A1Q14993 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL19A1Q14993 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL19A1Q14993 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
COL19A1Q14993 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL19A1Q14993 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
COL19A1Q14993 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms