Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HNF4GQ14541 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms