Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTAN1Q13813 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTAN1Q13813 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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