Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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