Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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PEX6Q13608 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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PEX6Q13608 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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PEX6Q13608 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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