Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BFSP2Q13515 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms