Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPM6BQ13491 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPM6BQ13491 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPM6BQ13491 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPM6BQ13491 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPM6BQ13491 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPM6BQ13491 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPM6BQ13491 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPM6BQ13491 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPM6BQ13491 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPM6BQ13491 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPM6BQ13491 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPM6BQ13491 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPM6BQ13491 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GPM6BQ13491 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPM6BQ13491 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPM6BQ13491 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPM6BQ13491 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPM6BQ13491 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPM6BQ13491 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPM6BQ13491 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPM6BQ13491 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPM6BQ13491 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPM6BQ13491 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPM6BQ13491 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPM6BQ13491 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPM6BQ13491 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPM6BQ13491 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPM6BQ13491 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GPM6BQ13491 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GPM6BQ13491 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPM6BQ13491 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPM6BQ13491 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPM6BQ13491 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GPM6BQ13491 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GPM6BQ13491 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPM6BQ13491 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms