Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.33■■□□□ 1
AP3B2Q13367 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AP3B2Q13367 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
AP3B2Q13367 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AP3B2Q13367 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AP3B2Q13367 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AP3B2Q13367 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3B2Q13367 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3B2Q13367 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AP3B2Q13367 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AP3B2Q13367 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3B2Q13367 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3B2Q13367 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AP3B2Q13367 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3B2Q13367 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
AP3B2Q13367 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3B2Q13367 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AP3B2Q13367 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3B2Q13367 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3B2Q13367 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3B2Q13367 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AP3B2Q13367 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AP3B2Q13367 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3B2Q13367 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3B2Q13367 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3B2Q13367 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3B2Q13367 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3B2Q13367 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AP3B2Q13367 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
AP3B2Q13367 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
AP3B2Q13367 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
AP3B2Q13367 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AP3B2Q13367 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AP3B2Q13367 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3B2Q13367 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3B2Q13367 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3B2Q13367 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3B2Q13367 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3B2Q13367 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AP3B2Q13367 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AP3B2Q13367 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3B2Q13367 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AP3B2Q13367 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AP3B2Q13367 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3B2Q13367 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3B2Q13367 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AP3B2Q13367 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
AP3B2Q13367 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AP3B2Q13367 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP3B2Q13367 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP3B2Q13367 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP3B2Q13367 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP3B2Q13367 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP3B2Q13367 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP3B2Q13367 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AP3B2Q13367 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
AP3B2Q13367 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP3B2Q13367 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP3B2Q13367 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP3B2Q13367 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AP3B2Q13367 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AP3B2Q13367 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AP3B2Q13367 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
AP3B2Q13367 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AP3B2Q13367 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AP3B2Q13367 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP3B2Q13367 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AP3B2Q13367 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP3B2Q13367 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP3B2Q13367 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AP3B2Q13367 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AP3B2Q13367 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AP3B2Q13367 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AP3B2Q13367 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AP3B2Q13367 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.3■■□□□ 1
AP3B2Q13367 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP3B2Q13367 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP3B2Q13367 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP3B2Q13367 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AP3B2Q13367 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP3B2Q13367 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
AP3B2Q13367 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
AP3B2Q13367 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
AP3B2Q13367 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.3■■□□□ 1
AP3B2Q13367 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms