Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRSQ13332 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms