Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATMQ13315 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATMQ13315 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATMQ13315 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATMQ13315 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATMQ13315 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATMQ13315 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATMQ13315 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATMQ13315 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATMQ13315 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATMQ13315 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATMQ13315 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATMQ13315 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATMQ13315 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATMQ13315 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATMQ13315 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATMQ13315 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATMQ13315 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATMQ13315 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATMQ13315 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATMQ13315 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATMQ13315 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATMQ13315 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATMQ13315 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATMQ13315 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATMQ13315 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATMQ13315 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATMQ13315 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATMQ13315 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATMQ13315 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATMQ13315 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATMQ13315 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATMQ13315 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATMQ13315 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATMQ13315 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATMQ13315 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATMQ13315 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATMQ13315 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATMQ13315 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATMQ13315 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATMQ13315 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATMQ13315 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATMQ13315 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATMQ13315 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATMQ13315 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATMQ13315 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATMQ13315 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATMQ13315 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATMQ13315 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATMQ13315 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATMQ13315 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATMQ13315 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATMQ13315 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATMQ13315 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATMQ13315 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATMQ13315 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATMQ13315 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATMQ13315 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATMQ13315 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATMQ13315 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATMQ13315 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATMQ13315 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATMQ13315 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATMQ13315 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATMQ13315 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATMQ13315 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATMQ13315 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATMQ13315 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATMQ13315 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATMQ13315 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATMQ13315 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATMQ13315 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATMQ13315 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATMQ13315 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATMQ13315 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATMQ13315 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATMQ13315 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATMQ13315 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATMQ13315 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATMQ13315 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATMQ13315 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATMQ13315 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATMQ13315 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATMQ13315 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATMQ13315 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATMQ13315 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATMQ13315 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATMQ13315 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATMQ13315 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATMQ13315 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATMQ13315 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATMQ13315 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATMQ13315 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATMQ13315 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATMQ13315 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATMQ13315 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATMQ13315 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATMQ13315 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATMQ13315 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATMQ13315 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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