Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM28Q13263 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM28Q13263 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM28Q13263 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM28Q13263 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM28Q13263 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM28Q13263 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM28Q13263 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM28Q13263 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM28Q13263 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM28Q13263 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM28Q13263 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM28Q13263 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM28Q13263 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM28Q13263 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM28Q13263 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM28Q13263 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM28Q13263 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
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