Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DUSP4Q13115 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DUSP4Q13115 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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