Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms