Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TROQ12816 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TROQ12816 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TROQ12816 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TROQ12816 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TROQ12816 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TROQ12816 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TROQ12816 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TROQ12816 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TROQ12816 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TROQ12816 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TROQ12816 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TROQ12816 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TROQ12816 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TROQ12816 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TROQ12816 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TROQ12816 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TROQ12816 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TROQ12816 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TROQ12816 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TROQ12816 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TROQ12816 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TROQ12816 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TROQ12816 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TROQ12816 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TROQ12816 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TROQ12816 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TROQ12816 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TROQ12816 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TROQ12816 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TROQ12816 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TROQ12816 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TROQ12816 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TROQ12816 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TROQ12816 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TROQ12816 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TROQ12816 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TROQ12816 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TROQ12816 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TROQ12816 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TROQ12816 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TROQ12816 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TROQ12816 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TROQ12816 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TROQ12816 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TROQ12816 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TROQ12816 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TROQ12816 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TROQ12816 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TROQ12816 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TROQ12816 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TROQ12816 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TROQ12816 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TROQ12816 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TROQ12816 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TROQ12816 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TROQ12816 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TROQ12816 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TROQ12816 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TROQ12816 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TROQ12816 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TROQ12816 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TROQ12816 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TROQ12816 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TROQ12816 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TROQ12816 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TROQ12816 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TROQ12816 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TROQ12816 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TROQ12816 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TROQ12816 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TROQ12816 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TROQ12816 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TROQ12816 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TROQ12816 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TROQ12816 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
TROQ12816 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
TROQ12816 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TROQ12816 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TROQ12816 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TROQ12816 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TROQ12816 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TROQ12816 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TROQ12816 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TROQ12816 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TROQ12816 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TROQ12816 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TROQ12816 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TROQ12816 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TROQ12816 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TROQ12816 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TROQ12816 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TROQ12816 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TROQ12816 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TROQ12816 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TROQ12816 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TROQ12816 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TROQ12816 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TROQ12816 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TROQ12816 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
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