Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC15Q0P6D6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC15Q0P6D6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC15Q0P6D6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC15Q0P6D6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms