Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms