Protein–RNA interactions for Protein: Q05932

FPGS, Folylpolyglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGSQ05932 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FPGSQ05932 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms