Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CALD1Q05682 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALD1Q05682 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms