Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF11Q05519 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms