Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPTBN1Q01082 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms