Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMAD3P84022 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SMAD3P84022 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms