Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL8P80075 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL8P80075 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL8P80075 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL8P80075 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL8P80075 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL8P80075 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL8P80075 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL8P80075 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL8P80075 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL8P80075 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL8P80075 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL8P80075 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL8P80075 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL8P80075 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL8P80075 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL8P80075 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL8P80075 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL8P80075 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL8P80075 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL8P80075 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL8P80075 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL8P80075 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL8P80075 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL8P80075 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL8P80075 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL8P80075 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL8P80075 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL8P80075 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL8P80075 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL8P80075 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL8P80075 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL8P80075 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL8P80075 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL8P80075 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL8P80075 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL8P80075 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL8P80075 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL8P80075 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL8P80075 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL8P80075 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL8P80075 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL8P80075 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL8P80075 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL8P80075 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL8P80075 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL8P80075 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL8P80075 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL8P80075 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL8P80075 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL8P80075 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL8P80075 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL8P80075 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL8P80075 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL8P80075 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL8P80075 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL8P80075 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL8P80075 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL8P80075 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL8P80075 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CCL8P80075 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL8P80075 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL8P80075 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL8P80075 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL8P80075 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL8P80075 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL8P80075 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL8P80075 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL8P80075 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCL8P80075 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL8P80075 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL8P80075 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL8P80075 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL8P80075 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL8P80075 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL8P80075 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL8P80075 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL8P80075 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL8P80075 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL8P80075 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL8P80075 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL8P80075 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL8P80075 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL8P80075 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL8P80075 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL8P80075 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL8P80075 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL8P80075 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL8P80075 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL8P80075 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL8P80075 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL8P80075 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL8P80075 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL8P80075 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL8P80075 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL8P80075 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL8P80075 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL8P80075 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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