Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRX3P78415 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRX3P78415 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRX3P78415 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRX3P78415 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRX3P78415 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRX3P78415 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRX3P78415 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRX3P78415 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRX3P78415 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRX3P78415 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRX3P78415 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRX3P78415 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRX3P78415 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRX3P78415 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRX3P78415 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRX3P78415 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRX3P78415 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRX3P78415 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRX3P78415 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRX3P78415 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRX3P78415 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRX3P78415 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRX3P78415 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
IRX3P78415 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
IRX3P78415 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRX3P78415 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRX3P78415 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRX3P78415 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRX3P78415 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRX3P78415 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRX3P78415 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRX3P78415 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRX3P78415 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRX3P78415 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRX3P78415 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRX3P78415 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRX3P78415 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRX3P78415 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRX3P78415 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
IRX3P78415 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRX3P78415 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRX3P78415 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRX3P78415 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRX3P78415 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRX3P78415 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRX3P78415 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRX3P78415 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRX3P78415 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRX3P78415 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRX3P78415 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRX3P78415 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRX3P78415 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRX3P78415 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRX3P78415 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRX3P78415 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRX3P78415 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRX3P78415 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRX3P78415 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRX3P78415 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRX3P78415 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRX3P78415 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRX3P78415 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRX3P78415 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRX3P78415 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRX3P78415 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRX3P78415 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRX3P78415 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRX3P78415 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IRX3P78415 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IRX3P78415 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IRX3P78415 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IRX3P78415 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IRX3P78415 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IRX3P78415 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
IRX3P78415 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
IRX3P78415 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IRX3P78415 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IRX3P78415 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRX3P78415 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRX3P78415 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRX3P78415 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRX3P78415 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRX3P78415 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRX3P78415 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRX3P78415 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRX3P78415 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRX3P78415 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRX3P78415 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
IRX3P78415 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRX3P78415 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRX3P78415 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRX3P78415 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
IRX3P78415 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRX3P78415 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRX3P78415 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRX3P78415 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRX3P78415 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRX3P78415 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRX3P78415 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms