Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2IP78347 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms