Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVS71-1P61550 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVS71-1P61550 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms