Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNB3P54284 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CACNB3P54284 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms