Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms